Le premier étage du musée est principalement consacré à l'art pictural de l'époque minoenne.
La Salle XIV offre une collection de fresques de Cnossos, et d'autres importantes localités de la Crète centrale orientale, parmi lesquelles l'on remarquera la procession des libations, le prince aux fleurs de lis, le taureau chargeant (fresque en relief), une tauromachie et la fresque des dauphins provenant de la chambre de la reine.